Audi SQ7 druhé generace přišel ke slovu nový naftový motor, který se rozloučil s monstry určenými pro model Q7 jako V12 6.0 TDI, resp. V8 4,2 TDI. Nově vyvinutý motor 4,0 TDI s 8 válci uspořádanými do V/90° také není žádný drobeček, nicméně vychází z objemu 3956 cm3 a s výkonem 320 kW i točivým momentem 900 Nm (1000–3250 min–1) je ve svém segmentu hodně vpředu. Model Audi SQ7 vážící 2,3 t dovede zrychlit na stovku za 4,8 s, rychlost má omezenou na 250 km/h a spokojí se se spotřebou 7,2 l/100 km (189 g CO2/km), měřeno současnou normou NEFZ. Nový motor si ovšem zasluhuje větší pozornost. Vůbec poprvé se u naftového agregátu značky Audi objevil systém proměnného zdvihu ventilů – Audi Valvelift Systém. Dvě klasická turbodmychadla s variabilním nastavením lopatek turbíny, která pracují selektivně, jsou uložena v prostoru mezi oběma řadami válců a vytvářejí tlak až 2,4 baru. Výzkumníci u Audi se už delší dobu zaměřují na dmychadlo s elektrickým pohonem, které se nyní u sériového motoru objevilo ve světové premiéře. Dmychadlo je uložené za jedním z chladičů komprimovaného vzduchu, není závislé na tlaku ve výfukovém traktu motoru a nabíhá téměř okamžitě po sešlápnutí plynového pedálu. Určeno je v první řadě pro rozběhovou fázi motoru, přičemž potřebný plnicí tlak dává už 205 ms od sepnutí. Navíc ještě minimalizuje tzv. turboefekt. Výkon potřebný pro provoz elektrického dmychadla, které dosahuje kolem 70 000 min–1, je až 7 kW, což zajišťuje dílčí palubní síť s napětím 48 V. Kompaktní li-ionový akumulátor je umístěný pod podlahou zavazadelníku s energetickým obsahem 0,5 kWh, může zajistit výkon až 13 kW. Připojení k 12V palubní síti má na starosti měnič DC/DC. Pozoruhodné je také, že vstřikování technologií Common Rail se děje pod tlakem až 2500 barů, což je nová nejvyšší hodnota u naftového motoru v uspořádání válců do V. Zvýšený vstřikovací tlak je příspěvkem k navýšení specifického výkonu motoru při nízkých emisích v oblasti dílčího výkonu.